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[ Source: openbabel  ]

Package: openbabel (2.2.3-1 and others)

cassetta degli attrezzi con utilità per la chimica

Open Babel è una cassetta degli attrezzi per la chimica progettata per capire i molti linguaggi dei dati chimici. Permette di cercare, convertire, analizzare o archiviare dati relativi ai campi dei modelli molecolari, chimica, materiali in stato solido, biochimica o aree correlate. Tra le sue caratteristiche sono incluse: 

 * aggiunta e cancellazione di idrogeni;
 * supporto per meccanica molecolare;
 * supporto per sintassi SMARTS per corrispondenze molecolari;
 * rilevamento automatico di caratteristiche (anelli, legami,
   ibridizzazioni, aromaticità);
 * tipizzatore flessibile per atomi e rilevazione di legami multipli dalle
   coordinate atomiche;
 * calcolo della carica parziale con metodo Gasteiger-Marsili.

I formati di file supportati da Open Babel includono PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC e MPQC.

Questo pacchetto contiene le seguenti utilità: 

 * babel: converte tra diversi formati di file relativi alla chimica;
 * obenergy: calcola l'energia di una molecola;
 * obminimize: ottimizza la geometria, minimizza l'energia di una molecola;
 * obgrep: programma di ricerca di molecole che usa modelli SMARTS;
 * obprop: stampa proprietà standard delle molecole;
 * obfit: sovrappone due molecole in base ad un modello;
 * obrotamer: genera coordinate conformero/rotamero;
 * obchiral: stampa informazioni sulla chiralità molecolare;
 * obrotate: ruota gli angoli diedri delle molecole in modalità non
   interattiva.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Other Packages Related to openbabel

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  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
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    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
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    Libreria C GNU: librerie condivise
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
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    Libreria C GNU: librerie condivise
    also a virtual package provided by libc6-udeb
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    dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
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  • dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]
    Libreria C GNU: librerie condivise
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [not armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
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    dep: libgcc1 (>= 1:4.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
    dep: libgcc1 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
    Package not available
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    libreria di supporto a GCC
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [not armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    La libreria GNU Standard C++, versione 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Libreria per determinare la sequenza di chiamate di un programma - runtime
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    libreria per la compressione - eseguibili

Download openbabel

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 2.2.3-1 127.1 kB524 kB [list of files]
amd64 2.2.3-1 122.7 kB480 kB [list of files]
armel 2.2.3-1+b1 111.5 kB420 kB [list of files]
hppa 2.2.3-1 124.1 kB444 kB [list of files]
hurd-i386 2.2.3-1 115.3 kB428 kB [list of files]
i386 2.2.3-1 118.1 kB428 kB [list of files]
ia64 2.2.3-1+b1 146.3 kB604 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 2.2.3-1 123.3 kB406 kB [list of files]
kfreebsd-i386 2.2.3-1 117.5 kB352 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 2.2.1-1 221.2 kB532 kB [list of files]
mips 2.2.3-1 117.5 kB464 kB [list of files]
mipsel 2.2.3-1 117.1 kB464 kB [list of files]
powerpc 2.2.3-1 138.1 kB508 kB [list of files]
s390 2.2.3-1 119.0 kB432 kB [list of files]
sparc 2.2.3-1 118.8 kB428 kB [list of files]