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[ Source: gromacs  ]

Package: gromacs (4.0.5-4 and others)

simulatore di dinamica molecolare, con strumenti di costruzione e di analisi

GROMACS è un pacchetto versatile per l'esecuzione di dinamiche molecolari, ovvero simulazioni delle equazioni newtoniane del moto per sistemi con un numero di particelle tra le centinaia e i milioni.

Progettato principalmente per biomolecole come proteine e lipidi con molte complesse interazioni di legame, GROMACS, essendo estremamente veloce nei calcoli per le interazioni di non-legame (che solitamente dominano le simulazioni) è anche utilizzato da molti gruppi per ricerche su sistemi non biologici, come ad esempio polimeri.

GROMACS offre senz'altro troppe funzionalità perché una descrizione sommaria possa rendergli giustizia. Un elenco più completo è disponibile all'indirizzo <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

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  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Libreria C GNU: librerie condivise
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]
    Libreria C GNU: librerie condivise
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    Libreria C GNU: librerie condivise
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    libreria di interscambio tra client di X11
  • dep: libsm6
    libreria X11 Session Management, gestione delle sessioni X11
  • dep: libx11-6
    libreria X11 lato client
  • rec: cpp
    Il preprocessore C del progetto GNU

Download gromacs

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 4.0.5-4 4,599.9 kB16480 kB [list of files]
amd64 4.0.5-4 4,379.3 kB15608 kB [list of files]
armel 4.0.5-4 4,775.8 kB17096 kB [list of files]
hppa 4.0.5-4 4,311.2 kB17676 kB [list of files]
i386 4.0.5-4 3,731.5 kB12556 kB [list of files]
ia64 4.0.5-4 6,250.3 kB35332 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 4.0.5-4 4,378.6 kB15544 kB [list of files]
kfreebsd-i386 4.0.5-4 3,727.1 kB12640 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 4.0.4-1 3,808.6 kB12524 kB [list of files]
mips 4.0.5-4 4,204.3 kB20460 kB [list of files]
mipsel 4.0.5-4 4,166.1 kB20460 kB [list of files]
powerpc 4.0.5-4 4,391.7 kB18336 kB [list of files]
s390 4.0.5-4 4,337.4 kB14540 kB [list of files]
sparc 4.0.5-4 4,027.2 kB16292 kB [list of files]