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[ Source: openbabel  ]

Package: openbabel (2.2.0-2)

cassetta degli attrezzi con utilità per la chimica

Open Babel è una cassetta degli attrezzi per la chimica progettata per capire i molti linguaggi dei dati chimici. Permette di cercare, convertire, analizzare o archiviare dati relativi ai campi dei modelli molecolari, chimica, materiali in stato solido, biochimica o aree correlate. Tra le sue caratteristiche sono incluse: 

 * aggiunta e cancellazione di idrogeni;
 * supporto per meccanica molecolare;
 * supporto per sintassi SMARTS per corrispondenze molecolari;
 * rilevamento automatico di caratteristiche (anelli, legami,
   ibridizzazioni, aromaticità);
 * tipizzatore flessibile per atomi e rilevazione di legami multipli dalle
   coordinate atomiche;
 * calcolo della carica parziale con metodo Gasteiger-Marsili.

I formati di file supportati da Open Babel includono PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC e MPQC.

Questo pacchetto contiene le seguenti utilità: 

 * babel: converte tra diversi formati di file relativi alla chimica;
 * obenergy: calcola l'energia di una molecola;
 * obminimize: ottimizza la geometria, minimizza l'energia di una molecola;
 * obgrep: programma di ricerca di molecole che usa modelli SMARTS;
 * obprop: stampa proprietà standard delle molecole;
 * obfit: sovrappone due molecole in base ad un modello;
 * obrotamer: genera coordinate conformero/rotamero;
 * obchiral: stampa informazioni sulla chiralità molecolare;
 * obrotate: ruota gli angoli diedri delle molecole in modalità non
   interattiva.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

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  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    libreria per la compressione - eseguibili

Download openbabel

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 222.4 kB596 kB [list of files]
amd64 222.3 kB580 kB [list of files]
arm 219.9 kB524 kB [list of files]
armel 210.6 kB516 kB [list of files]
hppa 224.5 kB540 kB [list of files]
i386 217.4 kB528 kB [list of files]
ia64 246.0 kB704 kB [list of files]
mips 214.5 kB560 kB [list of files]
mipsel 217.4 kB560 kB [list of files]
powerpc 242.6 kB616 kB [list of files]
s390 218.8 kB528 kB [list of files]
sparc 217.7 kB528 kB [list of files]