Paquet : sibsim4 (0.20-1)

[ Paquet source : sibsim4  ]

Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN

Le projet SIBsim4 est basé sur sim4, un programme pour aligner une séquence d'ADNc sur une séquence génomique, en tenant compte de l'existence d'introns. Dans SIBsim4, le code source original a été fortement remanié avec comme buts :

 - l'amélioration de la vitesse ;
 - l'utilisation de séquences d'ADN de l'ordre de grandeur d'un
    chromosome ;
 - une meilleure description des variants d'épissage ;
 - une meilleure description des sites de polyadénylation ;
 - des corrections et améliorations de code.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::TODO, use::comparing, Recherche, Format pris en charge: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à sibsim4

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

Télécharger sibsim4

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	34,0 ko	108,0 ko	[liste des fichiers]
armel	34,0 ko	104,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	30,2 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
i386	32,1 ko	96,0 ko	[liste des fichiers]
ia64	49,6 ko	156,0 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-amd64	34,0 ko	82,0 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-i386	32,0 ko	74,0 ko	[liste des fichiers]
mips	35,2 ko	116,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	35,5 ko	112,0 ko	[liste des fichiers]
powerpc	34,5 ko	108,0 ko	[liste des fichiers]
s390	34,6 ko	108,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	37,0 ko	104,0 ko	[liste des fichiers]
sparc	32,2 ko	104,0 ko	[liste des fichiers]