Paquet : poa (2.0+20060928-3)

[ Paquet source : poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à poa

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [non ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• sug: blast2

  Recherche de séquence par alignement local

Télécharger poa

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	49,7 ko	164,0 ko	[liste des fichiers]
armel	52,6 ko	176,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	47,8 ko	155,0 ko	[liste des fichiers]
i386	46,5 ko	155,0 ko	[liste des fichiers]
ia64	72,6 ko	293,0 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-amd64	49,7 ko	125,0 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-i386	46,5 ko	116,0 ko	[liste des fichiers]
mips	44,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	45,2 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
powerpc	47,6 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
s390	51,4 ko	171,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	57,3 ko	196,0 ko	[liste des fichiers]
sparc	45,3 ko	179,0 ko	[liste des fichiers]