Paquet : gromacs (4.5.5-1)

[ Paquet source : gromacs  ]

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, field::chemistry, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, interface::x11, role::program, Boîte à outils d'interface utilisateur: Bibliothèque X, Système X Window: Application

Autres paquets associés à gromacs

• dep: gromacs-data (= 4.5.5-1)

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [non ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libfftw3-3

  Library for computing Fast Fourier Transforms

• dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

  Bibliothèque de support GCC

• dep: libx11-6

  Bibliothèque X11 partie client

• dep: libxml2 (>= 2.7.4)

  Bibliothèque XML GNOME

• rec: cpp

  préprocesseur C GNU (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	5 789,4 ko	14 388,0 ko	[liste des fichiers]
armel	5 792,0 ko	12 600,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	6 801,3 ko	11 737,0 ko	[liste des fichiers]
i386	5 419,6 ko	13 384,0 ko	[liste des fichiers]
ia64	8 525,8 ko	25 808,0 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-amd64	5 764,6 ko	14 084,0 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-i386	5 368,1 ko	13 416,0 ko	[liste des fichiers]
mips	5 457,6 ko	12 488,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	5 466,0 ko	12 484,0 ko	[liste des fichiers]
powerpc	5 456,2 ko	11 416,0 ko	[liste des fichiers]
s390	5 432,3 ko	11 640,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	8 133,8 ko	17 810,0 ko	[liste des fichiers]
sparc	5 440,1 ko	11 280,0 ko	[liste des fichiers]