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Package: proda (1.0-7)

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Alignement multiple de séquences protéiques

ProDA est un programme pour détecter et aligner les régions homologues dans des collections de protéines comportant divers arrangements de domaines. À partir d'un ensemble de séquences non alignées, ProDA identifiera toutes les régions homologues apparaissant dans une ou plusieurs séquences et renverra une collection d'alignements multiples locaux pour chacune d'entre elles.

ProDA est publié dans : « Multiple alignment of protein sequences with repeats and rearrangements » de T.M. Phuong, C.B. Do, R.C. Edgar et S. Batzoglou. Nucleic Acids Research 2006 34(20), 5932-5942.

Tags: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

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