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Package: avogadro (1.0.1-3 and others)

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système de modélisation et d'imagerie moléculaire

Avogadro est un système de modélisation et d'imagerie moléculaire visant les molécules et les biomolécules. Il permet de visualiser des propriétés comme les orbites moléculaires ou les potentiels électriques et dispose d'un constructeur de molécules intuitif.

Fonctions disponibles : - modeleur moléculaire avec optimisation géométrique basée sur les champs de force automatique ; - mécanique moléculaire incluant des recherches de contraintes et de conformation ; - visualisation des orbites moléculaires et d'isosurfaces générales ; - visualisation de vibrations et graphique du spectre de vibration ; - gestion des cellules cristallographiques ; - création d'entrée pour des paquets chimiques Gaussian, GAMESS and MOLPRO ; - architecture de greffon flexible et script Python.

Les formats de fichiers qu'Avogadro peut lire incluent PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ainsi que les sorties Gaussian, GAMESS and MOLPRO.

Tags: Field: Chemistry, Role: Program, Interface Toolkit: Qt, Purpose: Data Visualization

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