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[ Paquet source : gromacs  ]

Paquet : gromacs (4.0.5-5)

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Autres paquets associés à gromacs

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: gromacs-data (= 4.0.5-5)
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
  • dep: libc6 (>= 2.10) [hppa]
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [non hppa, ia64]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    X11 Inter-Client Exchange library
  • dep: libsm6
    bibliothèque de gestion de sessions X11
  • dep: libx11-6 [amd64, armel, mips, mipsel, powerpc]
    Bibliothèque X11 partie client
    dep: libx11-6 (>= 0) [hppa, i386, ia64, s390, sparc]
  • dep: libxml2 (>= 2.4.30) [mips]
    Bibliothèque XML GNOME
  • rec: cpp
    Préprocesseur GNUC C (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 4 401,0 ko15736 ko [liste des fichiers]
armel 4 772,7 ko17116 ko [liste des fichiers]
hppa 4 305,6 ko17680 ko [liste des fichiers]
i386 3 760,1 ko12456 ko [liste des fichiers]
ia64 6 254,0 ko35372 ko [liste des fichiers]
mips 4 227,6 ko20476 ko [liste des fichiers]
mipsel 4 170,2 ko20476 ko [liste des fichiers]
powerpc 4 388,9 ko18356 ko [liste des fichiers]
s390 4 339,5 ko14560 ko [liste des fichiers]
sparc 4 027,6 ko16300 ko [liste des fichiers]