Package: blast2 (1:2.2.21.20090809-2)

[ Source: ncbi-tools6  ]

Recherche de séquence par alignement local

Le célèbre programme d'alignement de séquences. Ceci est la version « officielle » numéro 2 du NCBI. Le programme blastall accepte en entrée une séquence nucléotidique ou protéique, la compare au contenu de banques de données et renvoie à l'utilisateur un résumé des appariements.

NB : les banques de données elles-mêmes ne sont pas distribuées par Debian ; elles doivent être installées séparément.

Tags: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Science: Calculation, Scope: Utility, Purpose: Searching, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to blast2

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.7) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  bibliothèque C GNU embarquée : bibliothèques partagées
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]

  Bibliothèque de support GCC

• dep: libncbi6 (<< 6.1.20090809.1)

  NCBI libraries for biology applications

  dep: libncbi6 (>= 6.1.20090809)

• sug: libvibrant6a

  Bibliothèques NCBI pour applications biologiques graphiques

• sug: ncbi-rrna-data

  large rRNA BLAST databases distributed with the NCBI toolkit

• sug: ncbi-tools-bin

  Bibliothèques NCBI pour applications de biologie (utilitaires en mode texte)

• sug: ncbi-tools-x11

  Bibliothèques NCBI pour applications de biologie (utilitaires X)

Download blast2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	649.2 kB	1,376.0 kB	[list of files]
armel	654.8 kB	1,300.0 kB	[list of files]
i386	624.8 kB	1,260.0 kB	[list of files]
ia64	724.6 kB	2,032.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	640.7 kB	1,268.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	620.2 kB	1,174.0 kB	[list of files]
mips	629.5 kB	1,340.0 kB	[list of files]
mipsel	636.5 kB	1,340.0 kB	[list of files]
powerpc	640.4 kB	1,308.0 kB	[list of files]
s390	655.1 kB	1,324.0 kB	[list of files]
sparc	634.3 kB	1,276.0 kB	[list of files]