Télécharger le paquet source sibsim4:
Le projet SIBsim4 est basé sur sim4, un programme pour aligner une séquence d'ADNc sur une séquence génomique, en tenant compte de l'existence d'introns. Dans SIBsim4, le code source original a été fortement remanié avec comme buts :
- l'amélioration de la vitesse ;
- l'utilisation de séquences d'ADN de l'ordre de grandeur d'un
chromosome ;
- une meilleure description des variants d'épissage ;
- une meilleure description des sites de polyadénylation ;
- des corrections et améliorations de code.
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| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| alpha | 37.2 ko | 116 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 32.0 ko | 104 ko | [liste des fichiers] |
| arm | 31.0 ko | 96 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 32.9 ko | 104 ko | [liste des fichiers] |
| hppa | 33.6 ko | 104 ko | [liste des fichiers] |
| hurd-i386 | 29.9 ko | 96 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 30.4 ko | 96 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 | 47.3 ko | 152 ko | [liste des fichiers] |
| kfreebsd-amd64 (portage non officiel) | 33.3 ko | 80 ko | [liste des fichiers] |
| kfreebsd-i386 (portage non officiel) | 30.9 ko | 70 ko | [liste des fichiers] |
| m68k | 27.6 ko | 92 ko | [liste des fichiers] |
| mips | 34.2 ko | 112 ko | [liste des fichiers] |
| mipsel | 34.2 ko | 112 ko | [liste des fichiers] |
| powerpc | 33.9 ko | 108 ko | [liste des fichiers] |
| s390 | 33.7 ko | 104 ko | [liste des fichiers] |
| sparc | 31.2 ko | 104 ko | [liste des fichiers] |