Paquet : sibsim4 (0.17-1)

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Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN

Le projet SIBsim4 est basé sur sim4, un programme pour aligner une séquence d'ADNc sur une séquence génomique, en tenant compte de l'existence d'introns. Dans SIBsim4, le code source original a été fortement remanié avec comme buts :

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    chromosome ;
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 - une meilleure description des sites de polyadénylation ;
 - des corrections et améliorations de code.

Étiquettes: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Searching, Supports Format: Plain Text

Autres paquets associés à sibsim4

dépendances

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dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb
dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc0.3-udeb
dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

dep: libc6 (>= 2.7-1) [non alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

Télécharger sibsim4

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha	37,2 ko	116 ko	[liste des fichiers]
amd64	32,0 ko	104 ko	[liste des fichiers]
armel	32,9 ko	104 ko	[liste des fichiers]
avr32 (portage non officiel)	34,0 ko	92 ko	[liste des fichiers]
hppa	33,6 ko	104 ko	[liste des fichiers]
hurd-i386	29,9 ko	96 ko	[liste des fichiers]
i386	30,4 ko	96 ko	[liste des fichiers]
ia64	47,3 ko	152 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-amd64	33,2 ko	80 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-i386	31,3 ko	72 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	27,6 ko	92 ko	[liste des fichiers]
mips	34,2 ko	112 ko	[liste des fichiers]
mipsel	34,2 ko	112 ko	[liste des fichiers]
powerpc	33,9 ko	108 ko	[liste des fichiers]
s390	33,7 ko	104 ko	[liste des fichiers]
sparc	31,2 ko	104 ko	[liste des fichiers]