Paquet : python3-cutadapt (4.7-2 et autres)

[ Paquet source : python-cutadapt  ]

Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads (Python 3)

Cutadapt helps with biological sequence clean tasks by finding the adapter or primer sequences in an error-tolerant way. It can also modify and filter reads in various ways. Adapter sequences can contain IUPAC wildcard characters. Also, paired-end reads and even colorspace data is supported. If you want, you can also just demultiplex your input data, without removing adapter sequences at all.

This package contains the Python 3 module.

Autres paquets associés à python3-cutadapt

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: pigz

  implémentation parallèle de gzip

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.12) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.13) [non sparc64]

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-dnaio [hppa, ppc64, sparc64]

  Python 3 library for fast parsing of FASTQ and FASTA files

  dep: python3-dnaio (>= 1.2.0) [non hppa, ppc64, sparc64]

• dep: python3-xopen

  Python3 module to open compressed files transparently

Télécharger python3-cutadapt

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	4.7-2	242,2 ko	1 337,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	4.7-2	255,8 ko	1 131,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	4.7-2	234,9 ko	1 263,0 ko	[liste des fichiers]
armel	4.7-2	228,6 ko	1 019,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	4.7-2	234,9 ko	843,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	4.4-1+b1	307,5 ko	2 383,0 ko	[liste des fichiers]
i386	4.7-2	264,2 ko	1 159,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	4.7-2	289,5 ko	1 851,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	4.7-2	232,6 ko	1 027,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	4.7-2	224,5 ko	1 293,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	4.4-1+b1	320,2 ko	2 810,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	4.7-2	257,3 ko	1 647,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	4.7-2	262,9 ko	979,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	4.7-2	278,4 ko	1 117,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	4.4-1	158,5 ko	4 503,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	4.7-2	264,7 ko	1 067,0 ko	[liste des fichiers]