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[ Paquet source : poa  ]

Paquet : poa (2.0+20060928-2)

Alignement d'ordre partiel pour les alignements multiples de séquences

POA signifie Alignement d'Ordre Partiel (Partial Order Aligment en anglais). C'est un programme rapide d'alignement multiple de séquences. Ses points forts sont la vitesse, la déployabilité, la sensibilité et son aptitude supérieure à gérer les branchements et les indels dans l'alignement. L'alignement d'ordre partiel peut être combiné avec d'autres méthodes comme l'alignement progressif. POA aligne de manière optimale une paire d'alignements multiples de séquences et peut donc être utilisé directement avec des méthodes progressives comme CLUSTAL. Pour les alignements de grande taille, POA est de dix à trente fois plus rapide que CLUSTALW. POA a été publié dans Bioinformatics. 2004 Jul 10;20(10):1546-56.

Étiquettes: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Supports Format: Plain Text

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