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[ Source: melting  ]

Paquet : melting (4.2h-3)

computing the melting temperature of nucleic acid duplex

This program computes, for a nucleic acid duplex, the enthalpy, the entropy and the melting temperature of the helix-coil transitions. Three types of hybridisation are possible: DNA/DNA, DNA/RNA, and RNA/RNA. The program first computes the hybridisation enthalpy and entropy from the elementary parameters of each Crick's pair by the nearest-neighbor method. Then the melting temperature is computed. The set of thermodynamic parameters can be easily changed, for instance following an experimental breakthrough. Melting was published in Le Novère N. (2001), Bioinformatics, 17: 1226-1227.

Étiquettes: Biology: Nucleic Acids, Field: Molecular Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Supports Format: Plain Text

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    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • sug: melting-gui
    Graphical user interface for melting

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Architecture Taille du paquet Espace occupé Fichiers
alpha 211.3 ko604 ko [liste des fichiers]
amd64 210.8 ko596 ko [liste des fichiers]
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