Paquet : gromacs (4.0.5-4 et autres)

Liens pour gromacs

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source gromacs :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [www.gromacs.org]

Paquets similaires :

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Autres paquets associés à gromacs

dépendances

recommandations

suggestions

dep: gromacs-data (= 4.0.4-1) [m68k]

GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

dep: gromacs-data (= 4.0.5-4) [non m68k]
dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb
dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]

dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libfftw3-3

library for computing Fast Fourier Transforms
dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]

Runtime library for GNU Fortran applications
dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libice6 (>= 1:1.0.0)

bibliothèque d'échange entre les clients X11
dep: libsm6

bibliothèque de gestion de sessions X11
dep: libx11-6

Bibliothèque X11 partie client

rec: cpp

Préprocesseur GNUC C (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha	4.0.5-4	4 599,9 ko	16480 ko	[liste des fichiers]
amd64	4.0.5-4	4 379,3 ko	15608 ko	[liste des fichiers]
armel	4.0.5-4	4 775,8 ko	17096 ko	[liste des fichiers]
hppa	4.0.5-4	4 311,2 ko	17676 ko	[liste des fichiers]
i386	4.0.5-4	3 731,5 ko	12556 ko	[liste des fichiers]
ia64	4.0.5-4	6 250,3 ko	35332 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-amd64	4.0.5-4	4 378,6 ko	15544 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-i386	4.0.5-4	3 727,1 ko	12640 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	4.0.4-1	3 808,6 ko	12524 ko	[liste des fichiers]
mips	4.0.5-4	4 204,3 ko	20460 ko	[liste des fichiers]
mipsel	4.0.5-4	4 166,1 ko	20460 ko	[liste des fichiers]
powerpc	4.0.5-4	4 391,7 ko	18336 ko	[liste des fichiers]
s390	4.0.5-4	4 337,4 ko	14540 ko	[liste des fichiers]
sparc	4.0.5-4	4 027,2 ko	16292 ko	[liste des fichiers]