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[ Paquet source : gromacs  ]

Paquet : gromacs (4.0.5-4 et autres)

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Autres paquets associés à gromacs

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: gromacs-data (= 4.0.4-1) [m68k]
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
    dep: gromacs-data (= 4.0.5-4) [non m68k]
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    bibliothèque d'échange entre les clients X11
  • dep: libsm6
    bibliothèque de gestion de sessions X11
  • dep: libx11-6
    Bibliothèque X11 partie client
  • rec: cpp
    Préprocesseur GNUC C (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha 4.0.5-4 4 599,9 ko16480 ko [liste des fichiers]
amd64 4.0.5-4 4 379,3 ko15608 ko [liste des fichiers]
armel 4.0.5-4 4 775,8 ko17096 ko [liste des fichiers]
hppa 4.0.5-4 4 311,2 ko17676 ko [liste des fichiers]
i386 4.0.5-4 3 731,5 ko12556 ko [liste des fichiers]
ia64 4.0.5-4 6 250,3 ko35332 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 4.0.5-4 4 378,6 ko15544 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 4.0.5-4 3 727,1 ko12640 ko [liste des fichiers]
m68k (portage non officiel) 4.0.4-1 3 808,6 ko12524 ko [liste des fichiers]
mips 4.0.5-4 4 204,3 ko20460 ko [liste des fichiers]
mipsel 4.0.5-4 4 166,1 ko20460 ko [liste des fichiers]
powerpc 4.0.5-4 4 391,7 ko18336 ko [liste des fichiers]
s390 4.0.5-4 4 337,4 ko14540 ko [liste des fichiers]
sparc 4.0.5-4 4 027,2 ko16292 ko [liste des fichiers]