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[ Source: gromacs  ]

Paquet : gromacs (3.3.3-3 and others)

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Field: Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Autres paquets associés à gromacs

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: base-files (>= 4.0.1)
    Divers fichiers du système de base Debian
  • dep: gromacs-data (= 3.3.3-2) [kfreebsd-i386]
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
    dep: gromacs-data (= 3.3.3-3) [not kfreebsd-i386]
  • dep: lesstif2
    OSF/Motif 2.1 implementation released under LGPL
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9) [not kfreebsd-i386]
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    Bibliothèque d'échange entre les clients X11
  • dep: libsm6
    X11 Session Management library
  • dep: libx11-6
    Bibliothèque X11 partie client
  • dep: libxext6
    X11 miscellaneous extension library
  • dep: libxp6
    X Printing Extension (Xprint) client library
  • dep: libxt6
    Bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11
  • rec: cpp
    Préprocesseur GNUC C (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé Fichiers
alpha 3.3.3-3 4,259.0 ko14940 ko [liste des fichiers]
amd64 3.3.3-3 4,038.1 ko13996 ko [liste des fichiers]
arm 3.3.3-3 3,827.1 ko13068 ko [liste des fichiers]
armel 3.3.3-3 4,333.0 ko15028 ko [liste des fichiers]
hppa 3.3.3-3 3,915.9 ko15560 ko [liste des fichiers]
i386 3.3.3-3 3,441.1 ko11328 ko [liste des fichiers]
ia64 3.3.3-3 5,660.7 ko31296 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 (portage non officiel) 3.3.3-3 4,000.6 ko13852 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 (portage non officiel) 3.3.3-2 5,283.1 ko13276 ko [liste des fichiers]
m68k 3.3.3-3 3,453.1 ko11140 ko [liste des fichiers]
mips 3.3.3-3 3,798.0 ko17896 ko [liste des fichiers]
mipsel 3.3.3-3 3,768.5 ko17896 ko [liste des fichiers]
powerpc 3.3.3-3 3,822.7 ko14476 ko [liste des fichiers]
s390 3.3.3-3 3,925.6 ko12568 ko [liste des fichiers]
sparc 3.3.3-3 3,670.6 ko14412 ko [liste des fichiers]