Paquet : garlic (1.6-3 et autres)

[ Paquet source : garlic  ]

logiciel de visualisation de biomolécules

Garlic a été écrit pour l'analyse des protéines membranaires. Il permet aussi de visualiser les autres protéines, ainsi que d'autres objets géométriques. Cette version de Garlic reconnaît le format PDB version 2.1. Garlic peut aussi être utilisé pour analyser des séquences protéiques.

Il dépend uniquement des bibliothèque  X, aucune autre bibliothèque n'est nécessaire.

Parmi ses fonctions :

 – la position et l'épaisseur de la tranche sont visibles dans une petite
   fenêtre ;
 – les liaisons atomiques et les atomes sont traités comme des objets
   indépendants pour l'affichage ;
 – la couleur des atomes et des liaisons dépend de leur position. Cinq
   modes sont disponibles (comme pour la tranche) ;
 – il est capable de représenter des images stéréographiques ;
 – il est capable de représenter d'autres objets géométriques, comme une
   membrane ;
 – l'information sur un atome est disponible en déplaçant le pointeur de
   la souris au-dessus. Pas besoin de clic, il suffit de déplacer le
    pointeur au-dessus ;
 – il est capable de charger plus d'une structure ;
 – il est capable de représenter les diagrammes de Ramachandran, les roues
   hélicoïdales, les diagrammes de Venn, les profils d'hydrophobicité et
   les moments hydrophobes ;
 – l'invite de commande est disponible au bas de la fenêtre principale.
   Un message d'erreur et une ligne de commande peuvent être affichés.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Chimie, Interface utilisateur: interface::commandline, interface::graphical, Système X Window, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, uitoolkit::xlib, But: Visualisation de données, Système X Window: Application

Autres paquets associés à garlic

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.28) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libx11-6

  bibliothèque X11 partie client

• sug: garlic-doc

  logiciel de visualisation de biomolécules – documentation

• sug: openbabel

  boîte à outils de chimie – interface en ligne de commande

Télécharger garlic

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.6-3	231,8 ko	961,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.6-3+b1	218,3 ko	833,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.6-3	206,8 ko	776,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.6-3	200,0 ko	764,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.6-3	191,2 ko	596,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.6-3	205,2 ko	746,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.6-3	212,6 ko	868,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.6-3	263,8 ko	1 400,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.6-3	190,1 ko	740,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.6-3	213,1 ko	909,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.6-3	230,6 ko	984,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.6-3	257,4 ko	1 176,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.6-3+b1	230,4 ko	708,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.6-3	188,4 ko	788,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.6-3	259,7 ko	756,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.6-3	190,7 ko	787,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.6-3	216,5 ko	800,0 ko	[liste des fichiers]