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[ Paquet source : dialign  ]

Paquet : dialign (2.2.1-3)

Alignement de séquences multiples basé sur des segments

DIALIGN2 est un outil en ligne de commande pour effectuer des alignements multiples de séquences protéiques ou nucléotidiques. Il construit les alignements à partir de paires continues de segments similaires dans les séquences. Le système de notation des alignements est différent entre DIALIGN et les autres méthodes globales ou locales. Notez que DIALIGN n'utilise pas de pénalités d'insertion ou d'extension. DIALIGN2 a été publié dans : Morgenstern B. in Bioinformatics. 1999 Mar;15(3):211-8.

Étiquettes: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Autres paquets associés à dialign

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  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [non alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha 208,4 ko640 ko [liste des fichiers]
amd64 201,8 ko612 ko [liste des fichiers]
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avr32 (portage non officiel) 206,3 ko612 ko [liste des fichiers]
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hurd-i386 197,4 ko604 ko [liste des fichiers]
i386 199,5 ko608 ko [liste des fichiers]
ia64 227,9 ko716 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 203,1 ko598 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 198,3 ko592 ko [liste des fichiers]
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mips 206,5 ko640 ko [liste des fichiers]
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powerpc 204,3 ko616 ko [liste des fichiers]
s390 201,6 ko608 ko [liste des fichiers]
sparc 201,0 ko612 ko [liste des fichiers]