Paquet : boxshade (3.3.1-3)

Liens pour boxshade

Resources Debian :

Télécharger le paquet source boxshade:

Responsables :

Debian-Med Packaging Team (Page QA, Mail Archive)
Steffen Moeller (Page QA)
Charles Plessy (Page QA)
David Paleino (Page QA)
Andreas Tille (Page QA)

Ressources externes :

Page d'accueil [www.ch.embnet.org]

Paquets similaires :

Rendu élégant d'alignements multiples de séquences

Boxshade est conçu pour l'impression de documents de qualité présentant des séquences d'ADN ou des alignements multiples de protéines. Ce n'est pas un programme de calcul d'alignements, il lui faut un fichier en entrée créé par un outil de calcul d'alignement ou édité à la main.

Boxshade lit les alignements de séquences depuis les fichiers générés par les logiciels PILEUP-PSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED et ESEE (dans la limite de 150 séquences contenant au maximum 10 000 éléments chacune). De nombreux jeux d'ombre peuvent être utilisés. La sortie est affichée à l'écran ou peut être envoyée dans un fichier dans les formats suivants : ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML.

Étiquettes: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, Proteins, Software Development: Prettyprint, Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Plain Text, PostScript, TeX and LaTeX

Autres paquets associés à boxshade

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dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

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dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]

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also a virtual package provided by libc0.3-udeb
dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

sug: kalign

Alignement multiple, global et progressif de séquences

or clustalw

Alignement multiple, global et progressif de séquences

or mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

or hmmer

Prépare des modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
sug: seaview

Éditeur d'alignements de séquences multiples
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX supplementary packages
sug: xfig

Programme de création graphique sous X11

Télécharger boxshade

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé	Fichiers
alpha	54.8 ko	268 ko	[liste des fichiers]
amd64	51.0 ko	244 ko	[liste des fichiers]
arm	49.2 ko	236 ko	[liste des fichiers]
armel	51.4 ko	240 ko	[liste des fichiers]
hppa	53.1 ko	248 ko	[liste des fichiers]
hurd-i386	44.8 ko	228 ko	[liste des fichiers]
i386	44.9 ko	232 ko	[liste des fichiers]
ia64	65.8 ko	332 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 (portage non officiel)	51.0 ko	170 ko	[liste des fichiers]
kfreebsd-i386 (portage non officiel)	44.7 ko	156 ko	[liste des fichiers]
m68k	43.3 ko	224 ko	[liste des fichiers]
mips	52.2 ko	284 ko	[liste des fichiers]
mipsel	52.4 ko	284 ko	[liste des fichiers]
powerpc	50.5 ko	248 ko	[liste des fichiers]
s390	51.6 ko	248 ko	[liste des fichiers]
sparc	48.2 ko	240 ko	[liste des fichiers]