sarge  ] [  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: ncbi-tools6  ]

Paquet : blast2 (1:2.2.18.20080302-3 and others)

Recherche de séquence par alignement local

Le célèbre programme d'alignement de séquences. Ceci est la version « officielle » numéro 2 du NCBI. Le programme blastall accepte en entrée une séquence nucléotidique ou protéique, la compare au contenu de banques de données et renvoie à l'utilisateur un résumé des appariements.

NB : les banques de données elles-mêmes ne sont pas distribuées par Debian ; elles doivent être installées séparément.

Étiquettes: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching

Autres paquets associés à blast2

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [armel]
    Bibliothèque de support GCC
  • dep: libncbi6 (<< 6.1.20080302.1)
    NCBI libraries for biology applications
    dep: libncbi6 (>= 6.1.20080302)
  • sug: libvibrant6a
    Bibliothèques NCBI pour applications biologiques graphiques
  • sug: ncbi-tools-bin
    Bibliothèques NCBI pour applications de biologie (utilitaires en mode texte)
  • sug: ncbi-tools-x11
    Bibliothèques NCBI pour applications de biologie (utilitaires X)

Télécharger blast2

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé Fichiers
alpha 1:2.2.18.20080302-3 666.6 ko1460 ko [liste des fichiers]
amd64 1:2.2.18.20080302-3 650.7 ko1293 ko [liste des fichiers]
arm 1:2.2.18.20080302-3 625.0 ko1224 ko [liste des fichiers]
armel 1:2.2.18.20080302-3 639.6 ko1264 ko [liste des fichiers]
hppa 1:2.2.18.20080302-3 641.6 ko1268 ko [liste des fichiers]
i386 1:2.2.18.20080302-3 622.4 ko1192 ko [liste des fichiers]
ia64 1:2.2.18.20080302-3 726.3 ko1696 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 (portage non officiel) 1:2.2.18.20080302-3 643.1 ko1264 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 (portage non officiel) 1:2.2.18.20080302-3 619.9 ko1154 ko [liste des fichiers]
m68k 1:2.2.18.20080302-2 614.8 ko1224 ko [liste des fichiers]
mips 1:2.2.18.20080302-3 634.9 ko1336 ko [liste des fichiers]
mipsel 1:2.2.18.20080302-3 625.9 ko1336 ko [liste des fichiers]
powerpc 1:2.2.18.20080302-3 685.4 ko1400 ko [liste des fichiers]
s390 1:2.2.18.20080302-3 655.1 ko1312 ko [liste des fichiers]
sparc 1:2.2.18.20080302-3 632.7 ko1268 ko [liste des fichiers]