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[ Source: autodocksuite  ]

Paquet : autodock (4.0.1-3)

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Autres paquets associés à autodock

  • depends
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  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    Bibliothèque de support GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    Bibliothèque de support GCC
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    Bibliothèque de support GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [not armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Bibliothèque standard C++ de GNU, version 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme (exécutables)
  • rec: autogrid
    pre-calculate binding of ligands to their receptor

Télécharger autodock

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé Fichiers
alpha 1,494.0 ko1884 ko [liste des fichiers]
amd64 1,468.0 ko1820 ko [liste des fichiers]
arm 1,479.0 ko1816 ko [liste des fichiers]
armel 1,475.5 ko1812 ko [liste des fichiers]
hppa 1,496.3 ko1848 ko [liste des fichiers]
hurd-i386 1,450.8 ko1788 ko [liste des fichiers]
i386 1,449.7 ko1733 ko [liste des fichiers]
ia64 1,570.5 ko2228 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 (portage non officiel) 1,466.1 ko1836 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 (portage non officiel) 1,450.8 ko1804 ko [liste des fichiers]
m68k 1,438.1 ko1780 ko [liste des fichiers]
mips 1,501.0 ko1952 ko [liste des fichiers]
mipsel 1,499.5 ko1964 ko [liste des fichiers]
powerpc 1,476.0 ko1820 ko [liste des fichiers]
s390 1,460.7 ko1792 ko [liste des fichiers]
sparc 1,470.4 ko1832 ko [liste des fichiers]