[  sid  ]
[ Source: arb  ]

Paquet : arb (0.0.20071207.1-5 and others) [non-free]

Integrated package for sequence database handling and analysis

The ARB software is a graphically oriented package comprising various tools for sequence database handling and data analysis. A central database of processed (aligned) sequences and any type of additional data linked to the respective sequence entries is structured according to phylogeny or other user defined criteria.

The ARB project (latin, "arbor"=tree) is a joint initiative of the Lehrstuhl fuer Mikrobiologie http://www.mikro.biologie.tu-muenchen.de/ and the Lehrstuhl fuer Rechnertechnik und Rechnerorganisation http://wwwbode.informatik.tu-muenchen.de/ of the Technical University of Munich.

Étiquettes: Field: Biology, Implemented in: C++, Perl, User Interface: X Window System, Role: Program, Scope: Utility, X Window System: Application

Autres paquets associés à arb

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  • dep: arb-common (= 0.0.20071207.1-4) [sparc]
    Integrated package for sequence database handling and analysis
    dep: arb-common (= 0.0.20071207.1-5) [i386]
  • dep: fastdnaml (>= 1.2.2-4)
    Tool for construction of phylogenetic trees of DNA sequences
  • dep: freeglut3
    OpenGL Utility Toolkit
  • dep: libarb (= 0.0.20071207.1-4) [sparc]
    Integrated package for sequence database handling and analysis
    dep: libarb (= 0.0.20071207.1-5) [i386]
  • dep: libc6 (>= 2.7-1)
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    also a virtual package provided by libc6-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1)
    Bibliothèque de support GCC
  • dep: libgl1-mesa-glx
    Implémentation libre de l'API OpenGL -- exécutables GLX
    or libgl1
    Implémentation libre de l'API OpenGL -- exécutables GLX paquet virtuel fourni par libgl1-mesa-glide3, libgl1-mesa-glx, libgl1-mesa-swx11
  • dep: libglew1.5 (>= 1.5.0dfsg1)
    The OpenGL Extension Wrangler - runtime environment
  • dep: libglu1-mesa
    The OpenGL utility library (GLU)
    or libglu1
    paquet virtuel fourni par libglu1-mesa
  • dep: libglw1-mesa
    A free implementation of the OpenGL API -- runtime
    or libglw1
    paquet virtuel fourni par libglw1-mesa
  • dep: libmotif3
    Open Motif - shared libraries
  • dep: libpng12-0 (>= 1.2.13-4)
    Bibliothèque PNG (exécutables)
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1)
    Bibliothèque standard C++ de GNU, version 3
  • dep: libtiff4
    Bibliothèque pout le format graphique TIFF (Tag Image File Format)
  • dep: libx11-6
    X11 client-side library
  • dep: libxext6
    X11 miscellaneous extension library
  • dep: libxp6
    X Printing Extension (Xprint) client library
  • dep: libxpm4
    Bibliothèque pixmap X11
  • dep: libxt6
    Bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11
  • dep: molphy
    Program Package for MOLecular PHYlogenetics
  • dep: phylip (>= 3.6b)
    [Biology] A package of programs for inferring phylogenies
  • dep: readseq (>= 1-1)
    [Biologie] Conversion entre formats de séquences
  • dep: ssh
    secure shell client and server (metapackage)
  • dep: transfig
    Utilities for converting XFig figure files
  • dep: tree-puzzle (>= 5.0-3)
    Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum
  • dep: xviewg (>= 3.2p1.4-6)
    Bibliothèques partagées de XView
  • rec: xfig
    Programme de création graphique sous X11
  • sug: arb-database
    Paquet indisponible
  • sug: gnuplot
    A command-line driven interactive plotting program
  • sug: gv
    Affiche sous X les fichiers PostScript et PDF (utilise les widgets athena 3D)

Télécharger arb

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Architecture Version Taille du paquet Espace occupé Fichiers
i386 0.0.20071207.1-5 2,122.4 ko5184 ko [liste des fichiers]
sparc 0.0.20071207.1-4 2,187.1 ko5244 ko [liste des fichiers]