etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Paquet source : clustalx  ]

Paquet : clustalx (1.83-4) [non-free]

GUI for Clustal W

This package offers a GUI interface for the Clustal W multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

Étiquettes: Biology: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: X Window System, Role: Program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Lesstif/Motif, Purpose: Analysing, Comparing, Data Visualization, Supports Format: Plain Text, X Window System: Application

Autres paquets associés à clustalx

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: lesstif2
    OSF/Motif 2.1 implementation released under LGPL
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [non alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
  • dep: libncbi6 (>= 6.1.20030421)
    NCBI libraries for biology applications
  • dep: libvibrant6a (>= 6.1.20060507)
    Bibliothèques NCBI pour applications biologiques graphiques
  • dep: libx11-6
    Bibliothèque X11 partie client
  • dep: libxmu6
    Bibliothèque de différents utilitaires X11
  • dep: libxt6
    Bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11
  • sug: boxshade
    Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
  • sug: texshade
    Paquet indisponible
    ou texlive-latex-extra
    TeX Live: LaTeX supplementary packages

Télécharger clustalx

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha 271,5 ko812 ko [liste des fichiers]
amd64 242,9 ko700 ko [liste des fichiers]
arm 235,4 ko684 ko [liste des fichiers]
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hppa 248,8 ko708 ko [liste des fichiers]
i386 223,5 ko684 ko [liste des fichiers]
ia64 324,3 ko1076 ko [liste des fichiers]
mips 253,9 ko808 ko [liste des fichiers]
mipsel 258,8 ko824 ko [liste des fichiers]
powerpc 246,4 ko720 ko [liste des fichiers]
s390 238,3 ko704 ko [liste des fichiers]
sparc 231,2 ko688 ko [liste des fichiers]