Télécharger le paquet source apbs :
APBS est un paquet pour la résolution numérique de l'équation de Poisson-Boltzmann (PBE), un des modèles continus les plus populaires décrivant les interactions entre solutés moléculaires en milieu salinaqueux. Le continuum électrostatique joue un rôle important dans plusieurs domaines de la simulation biomoléculaire, incluant :
- la simulation des processus de diffusion pour déterminer les cinétiques
de liaison ligand-protéine et protéine-protéine ;
- la dynamique moléculaire de solvatation des biomolécules ;
- le calcul de l'énergie de solvatation et de liaison pour déterminer
les constantes d'équilibre de liaison ligand-protéine et
protéine-protéine afin d'aider à la conception rationelle de
médicaments ;
- les études de biomoléculaires de titration.
APBS est conçu pour évaluer efficacement les propriétés électrostatiques pour de telles simulations dans un spectre large d'échelle de longueur pour permettre l'étude de molécules de dix à des millions d'atomes.
|
|
|
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| alpha | 5 015,2 ko | 6768 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 4 928,4 ko | 6864 ko | [liste des fichiers] |
| arm | 5 018,7 ko | 6796 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 5 057,5 ko | 6972 ko | [liste des fichiers] |
| hppa | 4 994,1 ko | 6776 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 4 865,2 ko | 6668 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 | 5 259,9 ko | 7708 ko | [liste des fichiers] |
| mips | 5 087,2 ko | 6944 ko | [liste des fichiers] |
| mipsel | 5 087,3 ko | 6944 ko | [liste des fichiers] |
| powerpc | 4 993,8 ko | 6712 ko | [liste des fichiers] |
| s390 | 4 926,2 ko | 6652 ko | [liste des fichiers] |
| sparc | 4 916,4 ko | 6676 ko | [liste des fichiers] |