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[ Paquet source : openbabel  ]

Paquet : openbabel (2.2.0-2)

Chemical toolbox utilities

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include: 

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities: 

 * babel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode

Étiquettes: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Autres paquets associés à openbabel

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [non alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [non arm, armel, hppa]
    Bibliothèque de support GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    Bibliothèque de support GCC
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [non armel]
    Bibliothèque standard C++ de GNU, version 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme (exécutables)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger openbabel

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha 222,4 ko596 ko [liste des fichiers]
amd64 222,3 ko580 ko [liste des fichiers]
arm 219,9 ko524 ko [liste des fichiers]
armel 210,6 ko516 ko [liste des fichiers]
hppa 224,5 ko540 ko [liste des fichiers]
i386 217,4 ko528 ko [liste des fichiers]
ia64 246,0 ko704 ko [liste des fichiers]
mips 214,5 ko560 ko [liste des fichiers]
mipsel 217,4 ko560 ko [liste des fichiers]
powerpc 242,6 ko616 ko [liste des fichiers]
s390 218,8 ko528 ko [liste des fichiers]
sparc 217,7 ko528 ko [liste des fichiers]