Paquet : gromacs (3.3.3-2)

[ Paquet source : gromacs  ]

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, Chimie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Système X Window, Rôle: Programme, Boîte à outils d'interface utilisateur: Bibliothèque X, Système X Window: Application

Autres paquets associés à gromacs

• dep: base-files (>= 4.0.1)

  Divers fichiers du système de base Debian

• dep: gromacs-data (= 3.3.3-2)

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

• dep: lesstif2

  OSF/Motif 2.1 implementation released under LGPL

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [non alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libfftw3-3

  bibliothèque pour calculer des transformées de Fourier rapides

• dep: libgfortran3 [alpha]

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: libice6 (>= 1:1.0.0)

  Bibliothèque d'échange entre les clients X11

• dep: libsm6

  bibliothèque de gestion de sessions X11

• dep: libx11-6

  Bibliothèque X11 partie client

• dep: libxext6

  X11 miscellaneous extension library

• dep: libxp6

  X Printing Extension (Xprint) client library

• dep: libxt6

  Bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11

• rec: cpp

  Préprocesseur GNUC C (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha	7 219,6 ko	13 844,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	6 389,2 ko	14 660,0 ko	[liste des fichiers]
arm	6 100,3 ko	12 152,0 ko	[liste des fichiers]
armel	4 339,4 ko	14 964,0 ko	[liste des fichiers]
hppa	7 340,7 ko	13 188,0 ko	[liste des fichiers]
i386	5 529,8 ko	13 840,0 ko	[liste des fichiers]
ia64	10 306,6 ko	24 512,0 ko	[liste des fichiers]
mips	7 422,0 ko	15 016,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	7 398,4 ko	14 976,0 ko	[liste des fichiers]
powerpc	5 017,3 ko	11 644,0 ko	[liste des fichiers]
s390	6 163,3 ko	12 520,0 ko	[liste des fichiers]
sparc	6 577,6 ko	13 416,0 ko	[liste des fichiers]