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[ Paquet source : gromacs  ]

Paquet : gromacs (3.3.3-2)

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

GROMACS est un paquet polyvalent pour faire de la dynamique moléculaire, comme la simulation d'équations newtoniennes du mouvement de systèmes de millions de particules.

Il a été créé en premier lieu pour les molécules biochimiques comme les protéines et les lipides qui ont beaucoup d'interactions covalentes compliquées, mais comme GROMACS est extrêmement rapide pour calculer les interactions non covalentes (qui souvent dominent les simulations), beaucoup de groupes l'utilisent aussi pour la recherche sur des systèmes non biologiques, comme les polymères.

GROMACS propose tous les algorithmes que vous attendez habituellement d'une implémentation de dynamique moléculaire moderne, mais aussi quelques fonctions qui le distinguent de ses concurrents. Vous pouvez trouver une liste plus complète à l'adresse suivante : <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>

Étiquettes: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Autres paquets associés à gromacs

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: base-files (>= 4.0.1)
    Divers fichiers du système de base Debian
  • dep: gromacs-data (= 3.3.3-2)
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
  • dep: lesstif2
    OSF/Motif 2.1 implementation released under LGPL
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [non alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
    un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    Bibliothèque d'échange entre les clients X11
  • dep: libsm6
    bibliothèque de gestion de sessions X11
  • dep: libx11-6
    Bibliothèque X11 partie client
  • dep: libxext6
    bibliothèque de diverses extensions pour X11
  • dep: libxp6
    X Printing Extension (Xprint) client library
  • dep: libxt6
    Bibliothèque de la boîte à outils Intrinsics X11
  • rec: cpp
    Préprocesseur GNUC C (cpp)

Télécharger gromacs

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha 7 219,6 ko13844 ko [liste des fichiers]
amd64 6 389,2 ko14660 ko [liste des fichiers]
arm 6 100,3 ko12152 ko [liste des fichiers]
armel 4 339,4 ko14964 ko [liste des fichiers]
hppa 7 340,7 ko13188 ko [liste des fichiers]
i386 5 529,8 ko13840 ko [liste des fichiers]
ia64 10 306,6 ko24512 ko [liste des fichiers]
mips 7 422,0 ko15016 ko [liste des fichiers]
mipsel 7 398,4 ko14976 ko [liste des fichiers]
powerpc 5 017,3 ko11644 ko [liste des fichiers]
s390 6 163,3 ko12520 ko [liste des fichiers]
sparc 6 577,6 ko13416 ko [liste des fichiers]