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[ Paquet source : amap-align  ]

Paquet : amap-align (2.0-1)

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation. 

 Homepage: http://bio.math.berkeley.edu/amap/

Étiquettes: Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Supports Format: Plain Text

Autres paquets associés à amap-align

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: libc6 (>= 2.3.5-1)
    bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  • dep: libgcc2 (>= 4.1.0)
    Bibliothèque de support GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.0)
    Bibliothèque standard C++ de GNU, version 3

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m68k 88,6 ko244 ko [liste des fichiers]