Paquet : python3-cyvcf2 (0.30.18-1 et autres)

[ Paquet source : cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

Télécharger python3-cyvcf2

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.30.18-1+b2	783,8 ko	4 710,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.30.18-1+b2	755,0 ko	4 725,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.30.18-1+b2	753,1 ko	4 624,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.30.18-1+b2	754,1 ko	4 452,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.30.18-1+b2	782,4 ko	4 726,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.30.18-1+b2	735,7 ko	4 740,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	0.30.18-1+b2	735,5 ko	4 719,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.30.18-1+b2	778,0 ko	4 853,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.30.18-1+b2	745,3 ko	4 708,0 ko	[liste des fichiers]