Paketti: poa (2.0+20060928-3)

[ Source: poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin poa liittyvät paketit

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [ei ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• sug: blast2

  Basic Local Alignment Search Tool

Imuroi poa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	49.7 kt	164.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	52.6 kt	176.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	47.8 kt	155.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	46.5 kt	155.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64	72.6 kt	293.0 kt	[tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64	49.7 kt	125.0 kt	[tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386	46.5 kt	116.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips	44.9 kt	186.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	45.2 kt	186.0 kt	[tiedostoluettelo]
powerpc	47.6 kt	180.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390	51.4 kt	171.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	57.3 kt	196.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc	45.3 kt	179.0 kt	[tiedostoluettelo]