[  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: proda  ]

Paketti: proda (1.0-7)

Proteiinisarjojen moninainen rivitys

ProDA on järjestelmä mielivaltaisten proteiinikokoelmien homologisten alueiden sijoittumisen tunnistamiseen. Kun syötetään sarja sekvenssejä, ProDA tunnistaa kaikki yhdessä tai useammassa sekvenssissä esiintyvät homologiset alueet ja tulostaa näiden alueiden sijaintitiedot.

ProDA on julkaistu: Phuong T.M., Do C.B., Edgar R.C., and Batzoglou S. Multiple alignment of protein sequences with repeats and rearrangements. Nucleic Acids Research 2006 34(20), 5932-5942.

Tagit: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

Muut pakettiin proda liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [ei alpha, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [ei arm, armel, hppa, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    GCC:n apukirjasto
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
    GCC:n apukirjasto
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    GCC:n apukirjasto
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [ei armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU Standard C++ -kirjasto, versio 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    A library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi proda

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha 73.1 kt232 kt [tiedostoluettelo]
amd64 66.6 kt196 kt [tiedostoluettelo]
arm 70.0 kt196 kt [tiedostoluettelo]
armel 64.5 kt184 kt [tiedostoluettelo]
hppa 73.1 kt208 kt [tiedostoluettelo]
i386 62.0 kt144 kt [tiedostoluettelo]
ia64 99.3 kt376 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64 (epävirallinen siirros) 66.6 kt168 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386 (epävirallinen siirros) 62.8 kt158 kt [tiedostoluettelo]
m68k 54.8 kt184 kt [tiedostoluettelo]
mips 70.0 kt248 kt [tiedostoluettelo]
mipsel 70.2 kt248 kt [tiedostoluettelo]
powerpc 71.3 kt208 kt [tiedostoluettelo]
s390 62.4 kt188 kt [tiedostoluettelo]
sparc 63.2 kt192 kt [tiedostoluettelo]