Paketti: perlprimer (1.1.18-1)

Alukkeiden graafinen suunnittelu polymeraasiketjureaktiota varten

PerlPrimer on vapaa, avoimen lähdekoodin Perlillä kirjoitettu graafinen käyttöliittymä alukkeiden suunnittelemiseksi polymeraasiketjureaktiota (PCR), bisulfiitti-PCR:ää, reaaliaikaista PCR:ää (QPCR) ja sekvenssointia varten. Se pyrkii automatisoimaan ja yksinkertaistamaan alukesuunnitteluprosessia.

Jos verkkoyhteys on käytettävissä, työkalu viestii Ensembl-projektin kanssa hankkiakseen lisätietoa geenirakenteesta. Tämä mahdollistaa esimerkiksi exoneiden ja introneiden sijaintien huomioon ottamisen alukkeita suunniteltaessa. Myös itse sekvenssejä voidaan noutaa.

Tagit: Biology: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Molecular Biology, Implemented in: Perl, User Interface: X Window System, Networking: Client, Role: Program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Tk, Purpose: Analysing, Supports Format: Plain Text, X Window System: Application