Paketti: muscle (1:3.8.31-1 ja muut)

[ Source: muscle  ]

Multiple alignment program of protein sequences

MUSCLE is a multiple alignment program for protein sequences. MUSCLE stands for multiple sequence comparison by log-expectation. In the authors tests, MUSCLE achieved the highest scores of all tested programs on several alignment accuracy benchmarks, and is also one of the fastest programs out there.

Tagit: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, biology::peptidic, field::biology, Field: Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin muscle liittyvät paketit

• dep: libc0.1 (>= 2.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb

• dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.3-udeb

• dep: libc6 (>= 2.11) [powerpcspe]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.13) [s390x, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.2) [mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [mips]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, armel, armhf, i386, powerpc, s390, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]

  dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

  dep: libc6 (>= 2.7-1) [hppa]

• dep: libc6.1 (>= 2.3.4) [ia64]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc1 [powerpcspe]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [ei armel, armhf, avr32, hppa, hurd-i386, m68k, powerpcspe]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [avr32, hurd-i386]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 [powerpcspe]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [ei armel, armhf, avr32, hppa, hurd-i386, m68k, powerpcspe]

  dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [hppa, m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [avr32, hurd-i386]

  dep: libstdc++6 (>= 4.3.0) [armel, armhf]

• dep: libunwind7 [ia64]

  A library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi muscle

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1:3.8.31-1	201.2 kt	573.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1:3.8.31-1	164.9 kt	468.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1:3.8.31-1	150.0 kt	422.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1:3.8.31-1	137.1 kt	352.0 kt	[tiedostoluettelo]
avr32 (epävirallinen siirros)	3.70+fix1-2	162.0 kt	428.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa	3.70+fix1-2	185.0 kt	524.0 kt	[tiedostoluettelo]
hurd-i386	3.70+fix1-2	156.6 kt	488.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1:3.8.31-1	159.9 kt	458.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64	1:3.8.31-1	245.4 kt	761.0 kt	[tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64	1:3.8.31-1	164.3 kt	430.0 kt	[tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386	1:3.8.31-1	159.6 kt	421.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	3.70+fix1-2	150.1 kt	468.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips	1:3.8.31-1	171.7 kt	505.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1:3.8.31-1	171.2 kt	503.0 kt	[tiedostoluettelo]
powerpc	1:3.8.31-1	177.5 kt	488.0 kt	[tiedostoluettelo]
powerpcspe (epävirallinen siirros)	3.70+fix1-2+b100	182.9 kt	520.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390	1:3.8.31-1	169.0 kt	472.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1:3.8.31-1	174.7 kt	508.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1:3.8.31-1	170.8 kt	460.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc	1:3.8.31-1	160.1 kt	453.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1:3.8.31-1	164.4 kt	424.0 kt	[tiedostoluettelo]