[  sarge  ] [  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: muscle  ]

Paketti: muscle (3.70+fix1-2)

Multiple alignment program of protein sequences

MUSCLE is a multiple alignment program for protein sequences. MUSCLE stands for multiple sequence comparison by log-expectation. In the authors tests, MUSCLE achieved the highest scores of all tested programs on several alignment accuracy benchmarks, and is also one of the fastest programs out there.

Tagit: Biology: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Muut pakettiin muscle liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [ei alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [ei arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    GCC:n apukirjasto
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    GCC:n apukirjasto
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    GCC:n apukirjasto
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [ei armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU Standard C++ -kirjasto, versio 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    A library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi muscle

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha 193.7 kt612 kt [tiedostoluettelo]
amd64 162.7 kt500 kt [tiedostoluettelo]
arm 155.4 kt409 kt [tiedostoluettelo]
armel 154.4 kt468 kt [tiedostoluettelo]
hppa 185.0 kt524 kt [tiedostoluettelo]
hurd-i386 156.6 kt488 kt [tiedostoluettelo]
i386 152.4 kt472 kt [tiedostoluettelo]
ia64 242.3 kt812 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64 (epävirallinen siirros) 162.0 kt482 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386 (epävirallinen siirros) 153.6 kt466 kt [tiedostoluettelo]
m68k 150.1 kt468 kt [tiedostoluettelo]
mips 191.1 kt660 kt [tiedostoluettelo]
mipsel 190.7 kt660 kt [tiedostoluettelo]
powerpc 176.4 kt528 kt [tiedostoluettelo]
s390 165.0 kt500 kt [tiedostoluettelo]
sparc 158.3 kt500 kt [tiedostoluettelo]