[  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: melting  ]

Paketti: melting (4.2h-3)

computing the melting temperature of nucleic acid duplex

This program computes, for a nucleic acid duplex, the enthalpy, the entropy and the melting temperature of the helix-coil transitions. Three types of hybridisation are possible: DNA/DNA, DNA/RNA, and RNA/RNA. The program first computes the hybridisation enthalpy and entropy from the elementary parameters of each Crick's pair by the nearest-neighbor method. Then the melting temperature is computed. The set of thermodynamic parameters can be easily changed, for instance following an experimental breakthrough. Melting was published in Le Novère N. (2001), Bioinformatics, 17: 1226-1227.

Tagit: Biology: Nucleic Acids, Field: Molecular Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Supports Format: Plain Text

Muut pakettiin melting liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [ei alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
  • sug: melting-gui
    Graphical user interface for melting

Imuroi melting

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha 211.3 kt604 kt [tiedostoluettelo]
amd64 210.8 kt596 kt [tiedostoluettelo]
arm 206.4 kt592 kt [tiedostoluettelo]
armel 211.5 kt596 kt [tiedostoluettelo]
hppa 210.8 kt596 kt [tiedostoluettelo]
hurd-i386 206.3 kt592 kt [tiedostoluettelo]
i386 209.3 kt596 kt [tiedostoluettelo]
ia64 212.4 kt632 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64 (epävirallinen siirros) 207.3 kt436 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386 (epävirallinen siirros) 206.2 kt432 kt [tiedostoluettelo]
m68k 204.6 kt592 kt [tiedostoluettelo]
mips 210.6 kt600 kt [tiedostoluettelo]
mipsel 207.1 kt600 kt [tiedostoluettelo]
powerpc 207.4 kt596 kt [tiedostoluettelo]
s390 206.9 kt596 kt [tiedostoluettelo]
sparc 206.8 kt596 kt [tiedostoluettelo]