Paketti: libbio-db-hts-perl (3.01-4 ja muut)

[ Source: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Muut pakettiin libbio-db-hts-perl liittyvät paketit

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ei armhf]

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

  dep: perl (>= 5.38.2-3.2+b1) [armhf]

• dep: perlapi-5.38.2 [ei armel, armhf, hppa, m68k, sh4, x32]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa perl-base

• dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf, hppa, m68k, sh4, x32]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libbio-db-hts-perl

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	131.7 kt	536.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	3.01-4+b3	135.8 kt	426.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3.01-4+b3	130.5 kt	533.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	3.01-4+b3	132.4 kt	413.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	3.01-4+b3	131.4 kt	373.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	135.2 kt	455.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	3.01-4+b3	137.1 kt	441.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	145.4 kt	615.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	131.1 kt	421.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	3.01-4+b3	126.1 kt	542.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	133.8 kt	535.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3.01-4+b3	133.3 kt	534.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	3.01-4+b2	136.2 kt	397.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	3.01-4+b3	136.2 kt	439.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	137.5 kt	470.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	128.3 kt	2,332.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	3.01-4+b3	135.7 kt	421.0 kt	[tiedostoluettelo]