Paketti: hmmer2 (2.3.2+dfsg-12)

[ Source: hmmer2  ]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Muut pakettiin hmmer2 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libsquid1t64 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilities for biological sequence analysis

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-12)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Imuroi hmmer2

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	310.8 kt	2,462.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	307.0 kt	2,145.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	281.6 kt	2,387.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	269.3 kt	2,039.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	268.0 kt	1,607.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	293.3 kt	2,186.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	313.1 kt	2,455.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	335.7 kt	3,968.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	286.1 kt	1,925.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	304.6 kt	2,461.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	308.7 kt	2,965.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	308.2 kt	2,901.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	303.8 kt	1,864.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	301.5 kt	2,310.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	293.7 kt	2,258.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	272.8 kt	9,908.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	305.3 kt	2,099.0 kt	[tiedostoluettelo]