[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: dialign  ]

Paketti: dialign (2.2.1-3)

Segment-based multiple sequence alignment

DIALIGN2 is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It constructs alignments from gapfree pairs of similar segments of the sequences. This scoring scheme for alignments is the basic difference between DIALIGN and other global or local alignment methods. Note that DIALIGN does not employ any kind of gap penalty. It has been published by Morgenstern B. in Bioinformatics. 1999 Mar;15(3):211-8.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Muut pakettiin dialign liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [ei alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

Imuroi dialign

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
alpha 208.4 kt640 kt [tiedostoluettelo]
amd64 201.8 kt612 kt [tiedostoluettelo]
armel 203.8 kt612 kt [tiedostoluettelo]
avr32 (epävirallinen siirros) 206.3 kt612 kt [tiedostoluettelo]
hppa 205.4 kt616 kt [tiedostoluettelo]
hurd-i386 197.4 kt604 kt [tiedostoluettelo]
i386 199.5 kt608 kt [tiedostoluettelo]
ia64 227.9 kt716 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64 203.1 kt598 kt [tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386 198.3 kt592 kt [tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros) 192.0 kt596 kt [tiedostoluettelo]
mips 206.5 kt640 kt [tiedostoluettelo]
mipsel 206.6 kt640 kt [tiedostoluettelo]
powerpc 204.3 kt616 kt [tiedostoluettelo]
s390 201.6 kt608 kt [tiedostoluettelo]
sparc 201.0 kt612 kt [tiedostoluettelo]