Package: sibsim4 (0.20-1)

[ Source: sibsim4  ]

alinea secuencias de RNA expresadas en una plantilla de ADN

El proyecto SIBsim4 está basado en sim4, que es un programa diseñado para alinear una secuencia de ADN expresada con una secuencia genómica, permitiendo intrones. SIBsim4 está bastante rescrito respecto del código original, con los siguientes objetivos:

 * mejorar la velocidad;
 * permitir usar grandes secuencias de ADN, a escala cromosómica;
 * proporcionar una salida más detallada sobre los tipos de empalme;
 * proporcionar una salida más detallada sobre los sitios polyA;
 * arreglos y limpieza de código variados.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Searching, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to sibsim4

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Biblioteca empotrada GNU C: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  Biblioteca empotrada GNU C: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  Biblioteca empotrada GNU C: Bibliotecas compartidas
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	34.0 kB	108.0 kB	[list of files]
armel	34.0 kB	104.0 kB	[list of files]
i386	32.1 kB	96.0 kB	[list of files]
ia64	49.6 kB	156.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	34.0 kB	82.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	32.0 kB	74.0 kB	[list of files]
mips	35.2 kB	116.0 kB	[list of files]
mipsel	35.5 kB	112.0 kB	[list of files]
powerpc	34.5 kB	108.0 kB	[list of files]
s390	34.6 kB	108.0 kB	[list of files]
sparc	32.2 kB	104.0 kB	[list of files]