lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: sibsim4  ]

Package: sibsim4 (0.17-1)

alinea secuencias de RNA expresadas en una plantilla de ADN

El proyecto SIBsim4 está basado en sim4, que es un programa diseñado para alinear una secuencia de ADN expresada con una secuencia genómica, permitiendo intrones. SIBsim4 está bastante rescrito respecto del código original, con los siguientes objetivos:

 * mejorar la velocidad;
 * permitir usar grandes secuencias de ADN, a escala cromosómica;
 * proporcionar una salida más detallada sobre los tipos de empalme;
 * proporcionar una salida más detallada sobre los sitios polyA;
 * arreglos y limpieza de código variados.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Searching, Supports Format: Plain Text

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Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 32.0 kB104 kB [list of files]
armel 32.9 kB104 kB [list of files]
hppa 33.6 kB104 kB [list of files]
i386 30.4 kB96 kB [list of files]
ia64 47.3 kB152 kB [list of files]
mips 34.2 kB112 kB [list of files]
mipsel 34.2 kB112 kB [list of files]
powerpc 33.9 kB108 kB [list of files]
s390 33.7 kB104 kB [list of files]
sparc 31.2 kB104 kB [list of files]