etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: primer3  ]

Package: primer3 (1.1.4-1)

Herramienta para diseñar flancos de oligonucleótidos para la amplificación de ADN

Primer3 coge primers de Reacciones en Cadena de Polimerasa (PCR, en inglés), considerando como criterios la temperatura de fusión de los oligonucleótidos, su tamaño, el contenido de GC y las posibilidades primer-dimer, el tamaño del producto PCR, las restricciones posicionales en la secuencia fuente y otras restricciones variadas. Todos estos criterios son restricciones especificables por el usuario, y algunos son especificables como términos en una función objetivo que caracterice un par de primers óptimo.

Se ha publicado en «Rozen S and Skaletsky H, "Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers.", Methods Mol Biol. 2000;132:365-86».

El instituto Whitehead para la Investigación Biomédica proporciona una interfaz web para Primer3.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to primer3

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • sug: ncbi-epcr
    Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites

Download primer3

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 106.8 kB276 kB [list of files]
amd64 98.0 kB244 kB [list of files]
arm 99.9 kB240 kB [list of files]
armel 105.9 kB256 kB [list of files]
hppa 103.1 kB240 kB [list of files]
hurd-i386 95.7 kB236 kB [list of files]
i386 96.5 kB196 kB [list of files]
ia64 137.7 kB420 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 101.7 kB212 kB [list of files]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 97.1 kB198 kB [list of files]
m68k 88.0 kB228 kB [list of files]
mips 102.5 kB272 kB [list of files]
mipsel 102.6 kB272 kB [list of files]
powerpc 102.2 kB252 kB [list of files]
s390 97.7 kB236 kB [list of files]
sparc 97.8 kB248 kB [list of files]