[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: poa  ]

Package: poa (2.0+20060928-2)

Alineación de orden parcial para alineación de secuencias múltiples

POA es «Partial Order Alignment», un programa rápido para la alineación de secuencias múltiples (MSA) en bioinformática. Sus ventajas son la rapidez, escalabilidad, sensibilidad y la capacidad superior de manejar bifurcaciones/«indels» en la alineación. La alineación de orden parcial es una aproximación a MSA, que se puede combinar con los métodos existentes como la alineación progresiva. POA alinea de forma óptima un par de MSAs y a las que, por tanto, se les puede aplicar métodos de alineación progresiva como CLUSTAL. Para alineaciones grandes, el POA progresivo es entre 10 y 30 veces más rápido que CLUSTALW. POA se publicó en Bioinformatics. 10 de julio de 2004;20(10):1546-56.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Supports Format: Plain Text

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