Package: mipe (1.1-3)

Herramientas para guardar datos derivados de PCR

MIPE proporciona un formato estándar para intercambiar y/o almacenar toda la información asociada con experimentos de PCR usando un archivo de texto en claro. Esto:

 * le permitirá intercambiar datos de PCR entre investigadores/laboratorios
 * le permitirá hacer un seguimiento de los datos
 * le evitará problemas cuando envíe datos a dbSTS o dbSNP
 * le permitirá escribir secuencias de órdenes estándar para extraer

datos (p.ej. una lista de «primers» de PCR, posiciones de SNP o halotipos para animales diferentes)

Aunque esta herramienta se puede usar para almacenar datos, su principal enfoque es su intercambio. Las bases de datos relacionales son más apropiadas para almacenar estos datos de grandes repositorios. El formato de MIPE se podría usar como un formato estándar para importar y/o exportar desde estas bases de datos.

MIPE se publicó en: «Aerts J & Veenendaal T. MIPE - a XML-format to facilitate the storage and exchange of PCR-related data. Online Journal of Bioinformatics 6(2): 114-120 (2005).»

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Molecular Biology, Implemented in: Perl, User Interface: Command Line, Role: Documentation, Program, Scope: Utility, Purpose: Data Organisation, Supports Format: XML