Package: boxshade (3.3.1-3)

[ Source: boxshade  ]

impresión agradable de alineaciones de secuencias múltiples

Boxshade es un programa para crear impresiones de buena apariencia a partir de proteínas de alineación múltiple o secuencias de ADN. El programa no desarrolla el alineamiento por sí mismo y necesita que se le entregue un archivo creado por un programa de alineación múltiple o editado a mano con las herramientas respectivas.

Boxshade lee secuencias de alineación múltiple desde archivos de PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, datos de MALIGNED y archivos guardados de ESEE (limitado a un máximo de 150 secuencias de hasta 10000 elementos cada una). Se pueden aplicar varios tipos de sombreados a residuos idénticos/similares. La salida se dibuja en pantalla o en un archivo en los formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT o HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, Proteins, Software Development: Prettyprint, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Typesetting, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Plain Text, PostScript, TeX and LaTeX

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
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• sug: kalign

  alineación de secuencias múltiples global y progresiva

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  Programa de alineación múltiple para aminoácidos o secuencias de nucleótidos

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  Modelos de Markov de perfil oculto para el análisis de secuencias de proteínas

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  TeX Live: LaTeX supplementary packages

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  Herramienta para la generación interactiva de figuras bajo X11

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Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha	54.8 kB	268.0 kB	[list of files]
amd64	51.0 kB	244.0 kB	[list of files]
arm	49.2 kB	236.0 kB	[list of files]
armel	51.4 kB	240.0 kB	[list of files]
hppa	53.1 kB	248.0 kB	[list of files]
i386	44.9 kB	232.0 kB	[list of files]
ia64	65.8 kB	332.0 kB	[list of files]
mips	52.2 kB	284.0 kB	[list of files]
mipsel	52.4 kB	284.0 kB	[list of files]
powerpc	50.5 kB	248.0 kB	[list of files]
s390	51.6 kB	248.0 kB	[list of files]
sparc	48.2 kB	240.0 kB	[list of files]