[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: boxshade  ]

Package: boxshade (3.3.1-3)

impresión agradable de alineaciones de secuencias múltiples

Boxshade es un programa para crear impresiones de buena apariencia a partir de proteínas de alineación múltiple o secuencias de ADN. El programa no desarrolla el alineamiento por sí mismo y necesita que se le entregue un archivo creado por un programa de alineación múltiple o editado a mano con las herramientas respectivas.

Boxshade lee secuencias de alineación múltiple desde archivos de PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, datos de MALIGNED y archivos guardados de ESEE (limitado a un máximo de 150 secuencias de hasta 10000 elementos cada una). Se pueden aplicar varios tipos de sombreados a residuos idénticos/similares. La salida se dibuja en pantalla o en un archivo en los formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT o HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, Proteins, Software Development: Prettyprint, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Typesetting, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Plain Text, PostScript, TeX and LaTeX

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Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 54.8 kB268 kB [list of files]
amd64 51.0 kB244 kB [list of files]
arm 49.2 kB236 kB [list of files]
armel 51.4 kB240 kB [list of files]
hppa 53.1 kB248 kB [list of files]
i386 44.9 kB232 kB [list of files]
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