Paket: sibsim4 (0.20-1)

[ Quellcode: sibsim4  ]

Richtet exprimierte RNA-Sequenzen an einer DNA-Vorlage aus

Das SIBsim4-Projekt basiert auf sim4, einem Programm, das entwickelt wurde, um eine exprimierte DNA-Sequenz mit einer genomischen Sequenz abzustimmen um Intronen zu erlauben. SIBsim4 ist eine recht umfangreiche Neuerstellung des ursprünglichen Codes mit den folgenden Zielen:

 * Geschwindigkeitsverbesserung;
 * Einsetzbarkeit auf großen (Größenordnung von Chromosomen)
   DNA-Sequenzen;
 * detailliertere Ausgabe über Spleiß-Typen;
 * detailliertere Ausgabe über Poly(A)-Schwänze;
 * verschiedene Aufräumarbeiten und Verbesserungen des Codes.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::TODO, use::comparing, Suchen, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	34,0 kB	108,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	34,0 kB	104,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	30,2 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	32,1 kB	96,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64	49,6 kB	156,0 kB	[Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64	34,0 kB	82,0 kB	[Liste der Dateien]
kfreebsd-i386	32,0 kB	74,0 kB	[Liste der Dateien]
mips	35,2 kB	116,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	35,5 kB	112,0 kB	[Liste der Dateien]
powerpc	34,5 kB	108,0 kB	[Liste der Dateien]
s390	34,6 kB	108,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	37,0 kB	104,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc	32,2 kB	104,0 kB	[Liste der Dateien]