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Paket: gromacs (4.5.5-1)

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Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

GROMACS ist ein vielseitiges Paket, um Molekulardynamik vorzuführen, z.B. um die Newtonschen Bewegungsgleichungen für Systeme mit Hunderten bis zu Millionen von Teilchen zu simulieren.

Es wurde primär für biochemische Moleküle wie Proteine und Fette entworfen, die eine Vielzahl von komplizierten kovalenten Wechselwirkungen aufweisen, aber da GROMACS die nicht-kovalenten Interaktionen (welche in Simulationen dominieren) extrem schnell berechnen kann, nutzen viele Gruppen es auch für Forschungen an nicht-biologischen Systemen, z.B. an Polymeren.

GROMACS bietet bei weitem zu viele Möglichkeiten um ihm mit einer kurzen Beschreibung gerecht werden zu können. Eine bessere Übersicht bietet <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, field::chemistry, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::x11, role::program, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X-Window-System: Anwendung

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