[ Source: infernal ]
Package: infernal (1.0.2-1)
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Similar packages:
Folgerung von Alignments der RNA-Sekundärstruktur
Infernal (»INFERence of RNA ALignment«) durchsucht DNA-Sequenzdatenbanken nach RNA-Strukturen und Sequenzähnlichkeiten. Es ist eine Implementierung eines Spezialfalls der stochastisch kontextfreien Grammatiken, genannt Kovarianzmodell (CM). Ein CM ist wie ein Sequenzprofil, bewertet jedoch eine Kombination aus Sequenzübereinstimmung und Übereinstimmung sekundärer RNA-Strukturen. Daher kann CM in vielen Fällen eher RNA-Homologe erkennen, deren Sekundärstruktur besser konserviert ist als deren primäre Sequenz.
Dieses Werkzeug ist eine integrale Komponente der Datenbank Rfam.
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- GCC Support-Bibliothek
Download infernal
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 4,197.5 kB | 9,496.0 kB | [list of files] |
| armel | 4,175.3 kB | 8,520.0 kB | [list of files] |
| i386 | 3,946.7 kB | 8,728.0 kB | [list of files] |
| ia64 | 6,310.9 kB | 18,120.0 kB | [list of files] |
| kfreebsd-amd64 | 4,198.8 kB | 9,622.0 kB | [list of files] |
| kfreebsd-i386 | 3,946.6 kB | 8,838.0 kB | [list of files] |
| mips | 4,324.9 kB | 11,028.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 4,357.4 kB | 11,036.0 kB | [list of files] |
| powerpc | 4,092.6 kB | 8,884.0 kB | [list of files] |
| s390 | 4,040.3 kB | 8,536.0 kB | [list of files] |
| sparc | 3,682.5 kB | 8,264.0 kB | [list of files] |