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[ Quellcode: openbabel  ]

Paket: openbabel (2.2.3-1 und andere)

Chemiekastenwerkzeuge

Open Babel ist ein Chemiekasten, konzipiert, um die vielen Sprachen chemischer Daten zu sprechen. Es erlaubt die Suche, Konvertierung, Analyse oder Speicherung von Daten aus der molekularen Modellierung, Chemie, Festkörpermaterialien, Biochemie oder ähnlichen Gebieten. Einige Eigenschaften: 

 * Anheften und Entfernen von Wasserstoff
 * Unterstützung für molekulare Mechanik
 * Unterstützung für SMARTS molekulare Abgleichsyntax
 * Automatische Erkennung und Anzeige der Eigenschaften (Ringe,
   Bindungen, Hybridisierung, Aromatizität)
 * Flexible Atomzuordnung und Erkennung von multiplen Verbindungen
   der Atomkoordinaten
 * Berechnung der Partialladung nach Gasteiger-Marsili

Open Babels Dateiformatunterstützung umfasst: PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL, Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC und MPQC.

Dieses Paket enthält die folgenden Werkzeuge: 

 * babel: Konverter zwischen verschiedenen Chemiedateiformaten
 * obenergy: Berechnet die Energie einzelner Moleküle
 * ebminimize: Optimiert die Geometrie eines Moleküls so, dass die
   Energie minimal wird
 * obgrep: SMARTS-Muster verwendendes Molekül Suchprogramm
 * obprop: Gibt die standard Moleküleigenschaften aus
 * obfit: Überlagert zwei Moleküle anhand eines Musters
 * obrotamer: Generiert Konformere/Rotamer-Koordinaten
 * obchiral: Gibt die Chiralität von Molekülen aus
 * obrotate: Rotiert den Raumwinkel der Moleküle, im Batch-Betrieb

Markierungen: Feld: Chemie, Implementiert in: C++, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Daten-Konvertierung

Andere Pakete mit Bezug zu openbabel

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips, mipsel]
    dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [nicht armel, hppa]
    GCC Support-Bibliothek
    dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    GCC Support-Bibliothek
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [nicht armel]
    Die GNU stdc++-Bibliothek (Version 3)
    dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms zur Laufzeit
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

openbabel herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 2.2.3-1 122,7 kB480 kB [Liste der Dateien]
armel 2.2.3-1+b1 111,5 kB420 kB [Liste der Dateien]
hppa 2.2.3-1 124,1 kB444 kB [Liste der Dateien]
i386 2.2.3-1 118,1 kB428 kB [Liste der Dateien]
ia64 2.2.3-1+b1 146,3 kB604 kB [Liste der Dateien]
mips 2.2.3-1 117,5 kB464 kB [Liste der Dateien]
mipsel 2.2.3-1 117,1 kB464 kB [Liste der Dateien]
powerpc 2.2.3-1 138,1 kB508 kB [Liste der Dateien]
s390 2.2.3-1 119,0 kB432 kB [Liste der Dateien]
sparc 2.2.3-1 118,8 kB428 kB [Liste der Dateien]