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[ Quellcode: gromacs  ]

Paket: gromacs (4.0.5-5)

Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

GROMACS ist ein vielseitiges Paket, um Molekulardynamik vorzuführen, z.B. um die Newtonschen Bewegungsgleichungen für Systeme mit Hunderten bis zu Millionen von Teilchen zu simulieren.

Es wurde primär für biochemische Moleküle wie Proteine und Fette entworfen, die eine Vielzahl von komplizierten kovalenten Wechselwirkungen aufweisen, aber da GROMACS die nicht-kovalenten Interaktionen (welche in Simulationen dominieren) extrem schnell berechnen kann, nutzen viele Gruppen es auch für Forschungen an nicht-biologischen Systemen, z.B. an Polymeren.

GROMACS bietet bei weitem zu viele Möglichkeiten um ihm mit einer kurzen Beschreibung gerecht werden zu können. Eine bessere Übersicht bietet <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, Chemie, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, X Window-System, Rolle: Programm, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: gromacs-data (= 4.0.5-5)
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
  • dep: libc6 (>= 2.10) [hppa]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [nicht hppa, ia64]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libfftw3-3
    Bibliothek für Schnelle Fourier-Transformationen (Fast Fourier Transform, FFT)
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- Bibliothekspaket
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    X11-Inter-Client-Exchange-Bibliothek
  • dep: libsm6
    X11-Biblitothek für Sitzungsverwaltung
  • dep: libx11-6 [amd64, armel, mips, mipsel, powerpc]
    Clientseitige X11-Bibliothek
    dep: libx11-6 (>= 0) [hppa, i386, ia64, s390, sparc]
  • dep: libxml2 (>= 2.4.30) [mips]
    GNOME XML-Bibliothek
  • rec: cpp
    Der GNU C-Präprozessor (cpp)

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 4 401,0 kB15736 kB [Liste der Dateien]
armel 4 772,7 kB17116 kB [Liste der Dateien]
hppa 4 305,6 kB17680 kB [Liste der Dateien]
i386 3 760,1 kB12456 kB [Liste der Dateien]
ia64 6 254,0 kB35372 kB [Liste der Dateien]
mips 4 227,6 kB20476 kB [Liste der Dateien]
mipsel 4 170,2 kB20476 kB [Liste der Dateien]
powerpc 4 388,9 kB18356 kB [Liste der Dateien]
s390 4 339,5 kB14560 kB [Liste der Dateien]
sparc 4 027,6 kB16300 kB [Liste der Dateien]