Paket: dialign (2.2.1-3)

[ Quellcode: dialign  ]

Segmentbasierte Ausrichtung mehrerer Sequenzen

DIALIGN2 ist ein Konsolen-Werkzeug für die Ausrichtung mehrerer Protein- oder DNA-Sequenzen. Es erstellt Ausrichtungen ausgehend von lückenlosen Paaren ähnlicher Sequenzsegmente. Dieses Bewertungsverfahren ist der grundlegende Unterschied zwischen DIALIGN und anderen globalen oder lokalen Methoden für Sequenzausrichtungen. DIALIGN nutzt keinerlei »gap penalties« (Negativbewertungen für Lücken). Es wurde publiziert von B. Morgenstern in Bioinformatics 15(3):211-218 (1999).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Vergleichen, Unterstützt Formate: Reiner Text

Andere Pakete mit Bezug zu dialign

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [ia64]

  Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	201,8 kB	612,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	203,8 kB	612,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	199,5 kB	608,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64	227,9 kB	716,0 kB	[Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64	203,1 kB	598,0 kB	[Liste der Dateien]
kfreebsd-i386	198,3 kB	592,0 kB	[Liste der Dateien]
mips	206,5 kB	640,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	206,6 kB	640,0 kB	[Liste der Dateien]
powerpc	204,3 kB	616,0 kB	[Liste der Dateien]
s390	201,6 kB	608,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc	201,0 kB	612,0 kB	[Liste der Dateien]