[ Quellcode: clustalw ]
Paket: clustalw (2.1+lgpl-2~bpo60+1) [backports]
Links für clustalw
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket clustalw herunterladen:
- [clustalw_2.1+lgpl-2~bpo60+1.dsc]
- [clustalw_2.1+lgpl.orig.tar.gz]
- [clustalw_2.1+lgpl-2~bpo60+1.debian.tar.gz]
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [www.clustal.org]
Ähnliche Pakete:
Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
Clustal W führt ein Alignment mehrerer Nukleotid- oder Aminosäurensequenzen aus. Das Programm erkennt das Format der Eingabesequenzen und ob die Sequenzen aus Nuklein- (DNA/RNA) oder Aminosäuren (Proteine) bestehen. Das Ausgabeformat kann aus verschiedenen Formaten für multiple Alignments ausgewählt werden, etwa Phylip oder FASTA. Clustal W ist allgemein anerkannt.
Die Ausgabe von Clustal W kann händisch editiert werden, jedoch wird ein Alignment-Editor wie SeaView oder Clustal X empfohlen. Bei der Erstellung eines Modells aus Ihrem Alignment, kann die Ausgabe für verbesserte Datenbanksuchen verwendet werden. Das Debian-Paket hmmer erstellt dies mittels eines Hidden-Markov-Modells (HMM).
Andere Pakete mit Bezug zu clustalw
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- dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
- Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb
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- dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
- Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.2) [mips, mipsel]
- dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
- dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
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- dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]
- Die »Embedded GNU C Library«: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
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- dep: libgcc1 [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [nicht armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
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- dep: libstdc++6 [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
- Die GNU stdc++-Bibliothek (Version 3)
- dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [nicht kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
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- dep: libunwind7 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms zur Laufzeit
clustalw herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| amd64 | 338,1 kB | 860,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 318,1 kB | 772,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 326,8 kB | 844,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 | 484,5 kB | 1.728,0 kB | [Liste der Dateien] |
| kfreebsd-amd64 | 337,8 kB | 832,0 kB | [Liste der Dateien] |
| kfreebsd-i386 | 326,3 kB | 816,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips | 342,8 kB | 1.092,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mipsel | 342,5 kB | 1.092,0 kB | [Liste der Dateien] |
| powerpc | 348,8 kB | 876,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390 | 324,5 kB | 828,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc | 328,7 kB | 852,0 kB | [Liste der Dateien] |