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[ Quellcode: seaview  ]

Paket: seaview (1:2.4-1)

Editor für Multiple Sequenzalignments

SeaView ist ein von Manolo Gouy entwickelter, grafischer Editor für Multiple Sequenzalignments. Viele Alignment-Formate (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE) können gelesen und geschrieben werden. Alignments können manuell editiert werden. Der Anwender wird weiterhin durch die Integration externer Programme unterstützt; z. B., um DOT-PLOT oder MUSCLE zu starten, um das Alignment lokal zu verbessern.

Wenn Sie SeaView zu Forschungszwecken in einer veröffentlichten Arbeit verwenden, zitieren Sie bitte folgende Referenz:

Galtier, N., Gouy, M. and Gautier, C. (1996) »SeaView and Phylo_win, two graphic tools for sequence alignment and molecular phylogeny.« Comput. Applic. Biosci. 12:543-548.

Markierungen: Feld: Biologie, Implementiert in: C, C++, Benutzer-Schnittstellen: X Window-System, Rolle: Programm, Scope: Hilfswerkzeug, Interface Toolkit: FLTK, Zweck: Bearbeiten, Drucken, Unterstützt Formate: Reiner Text, X Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu seaview

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  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libfltk1.1 (>= 1.1.6) [nicht hurd-i386]
    Fast Light Toolkit - shared libraries
    dep: libfltk1.1 (>= 1.1.7-2) [hurd-i386]
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [nicht arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    GCC Support-Bibliothek
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    GCC Support-Bibliothek
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    GCC Support-Bibliothek
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [nicht armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Die GNU stdc++-Bibliothek (Version 3)
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms zur Laufzeit
  • dep: libx11-6
    Clientseitige X11-Bibliothek
  • rec: xterm
    X-Terminal-Emulator
  • sug: clustalw
    global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
  • sug: muscle
    Programm zur Ausrichtung mehrerer Proteinsequenzen

seaview herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 173,7 kB464 kB [Liste der Dateien]
amd64 151,7 kB400 kB [Liste der Dateien]
arm 146,6 kB384 kB [Liste der Dateien]
armel 144,5 kB380 kB [Liste der Dateien]
hppa 165,7 kB412 kB [Liste der Dateien]
hurd-i386 147,5 kB388 kB [Liste der Dateien]
i386 146,3 kB388 kB [Liste der Dateien]
ia64 216,1 kB616 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64 (inoffizielle Portierung) 152,4 kB354 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-i386 (inoffizielle Portierung) 147,8 kB354 kB [Liste der Dateien]
m68k 140,4 kB380 kB [Liste der Dateien]
mips 166,2 kB480 kB [Liste der Dateien]
mipsel 166,5 kB480 kB [Liste der Dateien]
powerpc 162,9 kB424 kB [Liste der Dateien]
s390 153,3 kB400 kB [Liste der Dateien]
sparc 146,1 kB388 kB [Liste der Dateien]