Paket: probcons (1.12-14 und andere)

[ Quellcode: probcons  ]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu probcons

• dep: libc6 (>= 2.27) [nicht alpha, ia64, riscv64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nicht armel, armhf, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• sug: probcons-extra

  Extraprogramme des probcons Paketes

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

probcons herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.12-14	142,6 kB	418,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.12-14	116,4 kB	377,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.12-14	109,1 kB	328,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.12-14	105,1 kB	347,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.12-14	103,2 kB	255,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.12-14	128,9 kB	366,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.12-14	102,4 kB	367,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.12-14	191,0 kB	741,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.12-14	96,7 kB	367,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.12-14	129,1 kB	410,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.12-14	134,5 kB	481,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.12-14	136,2 kB	417,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.12-14+b1	131,1 kB	303,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.12-14	99,7 kB	376,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.12-14	131,4 kB	312,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.12-14	117,5 kB	374,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.12-14	122,0 kB	371,0 kB	[Liste der Dateien]