Paket: plink1.9 (1.90~b7.2-231211-1 und andere)

[ Quellcode: plink1.9  ]

Werkzeugsatz für die Analyse von Zusammenhängen im gesamten Genom

Plink erwartet als Eingabe die Daten aus SNP-Chips (Single Nucleotide Polymorphismus) von vielen einzelnen Individuen und deren phänotypische Beschreibung einer Krankheit. Das Programm findet Verbindungen von einzelnen oder Paaren von DNA-Varianten mit einem Phänotyp. Es kann SNP-Erläuterungen aus einer Online-Quelle abrufen.

SNPs können einzeln oder als Paar auf ihren Zusammenhang mit Krankheitsphänotypen bewertet werden. Die gemeinsame Untersuchung von Varianten von Genkopien wird unterstützt. Eine Vielzahl von statistischen Tests wurde implementiert.

Plink1.9 ist eine umfassende Aktualisierung von plink mit neuen Algorithmen und neuen Methoden, schneller und sparsamer im Speicherverbrauch als das erste plink.

Bitte beachten Sie: Die ausführbare Anwendung wurde wegen eines Namenskonflikts zu plink1.9 umbenannt. Mehr dazu unter /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu plink1.9

• dep: libatlas3-base [hppa, sh4]

  Automatisch optimierte Software für Lineare Algebra, generische Bibliotheken

• dep: libblas3 [nicht hppa, sh4]

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [nicht hppa, sh4]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]

  Paket nicht verfügbar

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Paket nicht verfügbar

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht hppa, sh4]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hppa, sh4]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: libopenblas0

  Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)

  oder libblis4

  BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)

plink1.9 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.90~b7.2-231211-1	875,0 kB	2.134,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.90~b7.2-231211-1	783,1 kB	2.061,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.90~b7.2-231211-1	765,4 kB	1.449,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.90~b3b-150117-1+b1	803,7 kB	2.006,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.90~b7.2-231211-1	881,9 kB	2.377,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.90~b3b-150117-1	893,3 kB	1.716,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.90~b7.2-231211-1	874,1 kB	2.081,0 kB	[Liste der Dateien]